El modus operandi de Los Cromos, célula delictiva identificada como el brazo operativo del Cártel Jalisco Nueva Generación (CJNG), operó al amparo del Corredor Interoceánico para expandir la extorsión, el despojo de tierras y la violencia regional, de acuerdo con fuentes federales y locales.Incluso, la Secretaría de la Defensa Nacional documentó, desde 2021 a través de Guacamaya Leaks, el interés del crimen organizado en el istmo de Tehuantepec.
En febrero de 2021, el Centro Regional de Fusión de Inteligencia, con sede en Coatzacoalcos, Veracruz, emitió un informe oficial en el que se reconoció que el avance de las obras se enfrentaba no sólo a la resistencia social, sino a la injerencia directa de la delincuencia.